שמואל נולד באלון מורה להוריו הרב אריה וציפורה הי"ו.
בגיל 6 עברה משפחתו לקרית ארבע שם למד שמואל בתלמוד תורה, היה חבר בתנועת אריאל והמשיך לישיבה התיכונית המקומית בכיתות ז'-ח'.
בכיתה ט' עבר לישל"צ בירושלים, בה בלט באישיותו המיוחדת - הנעימות, הענווה, היושר ואהבת התורה, שהופיעו בצד מעורבות חברתית ולקיחת אחריות אף על המחזורים הצעירים ממנו.
לאחר סיום התיכון, עבר שמואל ללמוד בישיבת "איילת השחר" באילת, בה הגיע להכרה כי "תורה צריך ללמוד ברצינות" והיות ולא הרגיש מוכן לכך עדיין, בחר להתגייס לצבא, שם שרת בגדוד 51 של גולני כחובש קרבי.
במהלך מבצע חומת מגן בעיר ג'נין, שם לחם גדודו, נפגע שמואל מירי צלף ערבי באחת מסמטאות מחנה הפליטים, בשעה שרץ להגיש עזרה לחבר שנפצע. שמואל קיבל צל"ש על מעשהו זה.